Лечение эндоцервицита обыкновенно проходит в два этапа. Для начала требуется устранить возбудителя инфекции, для этого будет подобран антибиотик, к которому чувствителен конкретный возбудитель. После устранения инфекции следует восстановить здоровую микрофлору влагалища для снижения вероятности возможного рецидива. Необходимо не забывать, что терапия будет успешной только если будут излечены все остальные воспалительные гинекологические заболевания.